Hola, soy nuevo en linux y quería saber sobre que debo estudiar para saber usar la terminal de linux y sus programas 
hola amigo primero puedes descargar la guia que existe metiéndote en DESCARGAR GUIA PDF KALI LINUX ahí te explica como empezar a saber los comando    
y luego tienes que saber los comando de distintas herramientas que existen ahí yo te recomiendo algunas 

ESCANEO DE PUERTOS        nmap -sn -v (y aqui va la direccion ip con /24 para hacer un escaneo de la red 
                                                   y despues nmap -sS -v (la direccion ip sin /24 para ver los puertos habiertos)

HACER UNA EXPLOTACION DE BULNERABILIDAD  metasploit 
con msfconsole 

por consejo personal investiga a estas dos herramientas si vas a comenzar a realizar pruebas de seguridad  
Lo que deseas es GNU, son las herramientas del sistema operativo para operarlo.
Busca los mas comunes y ya puedes ir profundizando poco a poco.
1337 & culture!
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